Yer verilen açıklamaya göre 2006 yılından beri, kamu kuruluşlarıyla yapılan protokoller çerçevesinde yapılar inşa edildiği ve bu çerçevede 15 bakanlık, 27 üniversite, 14 belediye, valilikler ve diğer kurumlarla 153’ü arsa karşılığı hasılat protokolü olmak üzere toplam 209 protokol yapıldığı bilgisine yer verildi. Devamında ise ilgili idarelerle protokol kapsamında yapılmış olan binaların maliyetlerinin bakanlıkların bütçe ödeneğinden karşılandığı ve Cumhurbaşkanlığı Sarayı’nın da bu çerçevede inşa edildiği belirtildi.
297 milyon lira alacağı olduğu iddialarına TOKİ şu açıklamaya yer vererek yalanladı: "Cumhurbaşkanlığı Sarayı’nın inşasından dolayı Toplu Konut İdaresi’nin 297 milyon alacağı olduğu’ iddiasıyla yayımlanan haberler doğru değildir. TOKİ’nin, Cumhurbaşkanlığı binasının inşası ile ilgili ödenen hak edişlerinden doğmuş bir alacağı yoktur. Binanın inşa edildiği arazinin Orman ve Su İşleri Bakanlığı’na ait olmasından dolayı araziden kaynaklı doğan alacak ise ilgili kurumlar arasında yapılacak görüşmeler neticesinde sonuçlandırılacaktır."